求可按首列匹配合并两制表符分隔文件的Bash脚本

先梳理你原awk命令的几个核心问题：

• 数组赋值逻辑错误：a[$1]=($2,$5,$7) 里的逗号是awk的表达式分隔符，这行实际只会把$7的值存入数组，而非$2、$5、$7的组合，需要用分隔符拼接三个字段后存储。
• 多余无效的END块：END { print($2 in a)} 完全没有意义，END块执行时已遍历完所有文件，$2无实际指向，逻辑也不符合需求。
• 缺失不匹配场景的处理：没有定义当File1的ID在File2中不存在时的输出规则。

正确的Awk命令 #

以下命令可实现你的需求：

awk '
    BEGIN { FS=OFS="\t" }  # 指定输入输出分隔符为制表符
    FNR==NR {
        # 处理File2，将第2、5、7字段用制表符拼接后存入数组
        a[$1] = $2 OFS $5 OFS $7
        next
    }
    # 处理File1
    {
        if ($1 in a) {
            # 匹配时输出原行+对应字段
            print $0, a[$1]
        } else {
            # 不匹配时输出原行+NO MATCH
            print $0, "NO MATCH"
        }
    }
' File2 File1

命令解释 #

• BEGIN { FS=OFS="\t" }：明确指定输入和输出的字段分隔符为制表符，确保和你的文件格式一致。
• FNR==NR：该条件仅在处理第一个文件（File2）时成立，此时将每个ID对应的第2、5、7字段用制表符拼接后存入数组a，键为ID。
• 处理第二个文件（File1）时，判断当前行ID是否在数组a中：
  • 存在则输出当前整行+数组中存储的对应字段；
  • 不存在则输出当前整行+NO MATCH。

测试结果 #

用你提供的测试文件运行该命令，输出完全符合预期：

ID1	-5.1	-4.4	juice	ill,safe	F25B9
ID2	-6.2	-3.8	NO MATCH
ID3	-8.9	-7.1	apple	block,use	G27H1
ID4	-14.6	-7.8	NO MATCH

内容的提问来源于stack exchange，提问作者AnnRi