使用Python Pandas合并Excel表格：填充空值合并失败求助

你的需求是以第一个Excel为基础，用第二个文件的非空值填充对应索引行的空单元格，核心是基于索引匹配后填充空值，而非拼接或合并行/列。

现有代码的问题 #

• pd.concat是纵向拼接两个DataFrame的行，会把两个文件的行全部保留，出现重复索引的行（比如示例中的1a、1b），完全不符合填充需求。
• 你尝试的pd.merge参数不全，且merge的作用是按列/索引合并数据，会生成重复列（比如B_x、B_y），并非用来填充空值的工具。

正确实现方法 #

使用pandas的combine_first方法，它的逻辑正好是：保留第一个DataFrame的所有非空值，用第二个DataFrame中对应索引和列的非空值填充第一个的空值，完美匹配你的需求。

完整代码：

import pandas as pd
import os

inputFolder = r'd:/testin'
outputFolder = r'd:/testout'

# 读取文件，指定首列为索引
file1 = pd.read_excel(os.path.join(inputFolder, 'input1.xlsx'), index_col=0)
file2 = pd.read_excel(os.path.join(inputFolder, 'input2.xlsx'), index_col=0)

# 用file2的非空值填充file1的空单元格
merged = file1.combine_first(file2)

# 保存结果，保留索引列
merged.to_excel(os.path.join(outputFolder, 'merged.xlsx'), index=True)

效果验证 #

运行后会得到你期望的结果：

• 索引1的C列空值被file2的C1填充，D列保留file1的D1
• 索引2的D列空值被file2的D2填充，B、C列保留file1的B2、C2
• 所有原有非空值都不会被覆盖

内容的提问来源于stack exchange，提问作者BenK