看起来你遇到的核心矛盾是明明已经正确安装并配置了Rtools40，但RStudio还是反复弹出安装提示。结合你的R版本（3.5）和已做的操作，我整理了几个针对性的解决方案：

• 重点排查：R版本与Rtools版本不兼容
  你的R是3.5版本，而Rtools40是专门为R 4.0及以上版本设计的配套工具！这大概率是问题的根源。你需要卸载当前的Rtools40，下载对应R 3.5的Rtools35版本重新安装，安装时勾选"Add Rtools to system PATH"选项，无需手动配置环境变量。

• 手动强制R识别Rtools路径
  如果你暂时不想更换Rtools版本，可以尝试在RStudio中执行以下命令，强制指定Rtools的路径：

  Sys.setenv(PATH = paste("C:/rtools40/usr/bin", Sys.getenv("PATH"), sep = ";"))
  # 验证是否生效
  devtools::find_rtools()
  

  也可以把这段配置写入你的.Rprofile文件（位于用户文档的R文件夹内），这样每次启动R都会自动加载该配置。

• 刷新RStudio的环境变量
  有时候RStudio不会自动刷新系统的环境变量变更，你可以尝试：

  • 完全关闭RStudio，重启电脑后再打开
  • 在RStudio中执行system("path")，查看输出里是否包含C:\rtools40\usr\bin，如果没有，说明环境变量没被正确继承，需要手动添加

• 用devtools工具全面检测编译环境
  运行devtools::has_devel()命令，这个命令会模拟编译一个小型的C程序，来验证你的编译环境是否完全正常。如果返回TRUE，说明环境没问题，那可能是RStudio的缓存问题，清空RStudio的缓存（在设置选项里找到清除缓存）再重启即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者RandomMonitor