解决data.table::fread()的cmd参数含单双引号的命令传递问题

你遇到的核心问题是R字符串中同时包含单引号和双引号时的解析冲突，下面提供两种可行的解决办法：

方法一：转义双引号并统一用双引号包裹cmd字符串 #

将sed命令中的单引号替换为双引号，同时在R字符串里对双引号进行转义（用\"），正则中的双引号也要额外转义一次（变成\\\"），确保shell能正确识别正则规则：

df <- fread(cmd = "unzip -p -a myfolder.zip | sed -Ee :1 -e \"s/^(([^\\\\\",]|\\\\\"[^\"]*\\\\\")*),/\\\\1|/;t1\"",
      sep = "|",
      header = TRUE,
      stringsAsFactors = FALSE,
      quote = "",
      fill = TRUE)

方法二：用单引号包裹cmd字符串，转义内部单引号 #

在R中，单引号包裹的字符串里，内部的单引号需要用两个连续单引号（''）转义，这样shell能正确解析sed命令：

df <- fread(cmd = 'unzip -p -a myfolder.zip | sed -Ee :1 -e \'\'s/^(([^\",]|\"[^\"]*\")*),/\\1|/;t1\'\'',
      sep = "|",
      header = TRUE,
      stringsAsFactors = FALSE,
      quote = "",
      fill = TRUE)

两种方法都能解决引号冲突问题，推荐第一种，可读性更强。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Annabanana