Docker中RUN指令安装tidyverse失败，提示非零退出状态

问题原因 #

报错中的systemfonts、textshaping、ragg均为编译型R包，依赖底层系统的字体/图形处理库，Docker基础镜像默认未预装这些库，导致R包编译安装失败，进而无法完成tidyverse的安装。

解决方案 #

在安装R包前，先通过系统包管理器安装所需的底层依赖库，再执行R包安装命令。

针对Debian/Ubuntu系基础镜像（如rocker/r-ver、debian:latest） #

在Dockerfile中添加系统依赖安装步骤：

# 更新包列表并安装依赖
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    fontconfig \
    libfreetype6-dev \
    libpng-dev \
    libharfbuzz-dev \
    libfribidi-dev \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

完整Dockerfile示例 #

FROM rocker/r-ver:4.3.1

# 安装系统依赖
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    fontconfig \
    libfreetype6-dev \
    libpng-dev \
    libharfbuzz-dev \
    libfribidi-dev \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

# 安装tidyverse
RUN R -e "install.packages(c('tidyverse'), repos='http://cran.rstudio.com/')"

针对Alpine系基础镜像 #

若使用Alpine作为基础镜像，替换为apk命令安装依赖：

RUN apk add --no-cache \
    fontconfig-dev \
    freetype-dev \
    libpng-dev \
    harfbuzz-dev \
    fribidi-dev

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Aryan Bharti