M1芯片MacBook Pro安装R包scater时依赖densvis编译失败求助

错误原因 #

你的M1芯片Mac上，R编译densvis时找不到适配arm64架构的gfortran库，报错里的/opt/gfortran路径是Intel架构的默认路径，和M1的arm64环境不匹配。

解决步骤 #

• 安装适配arm64的gfortran
  在终端执行以下命令，通过Homebrew安装适配M1的gcc套件（包含gfortran）：

  brew install gcc
  

  安装完成后，用which gfortran确认路径，一般会输出/opt/homebrew/bin/gfortran，对应的库路径为/opt/homebrew/lib/gcc/[你的gcc版本号]/（比如/opt/homebrew/lib/gcc/13/）。

• 给R指定正确的库路径
  打开R，运行以下代码设置临时环境变量（替换成你实际的gcc库路径）：

  Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH="/opt/homebrew/lib/gcc/13/")
  Sys.setenv(CFLAGS="-I/opt/homebrew/include")
  Sys.setenv(LDFLAGS="-L/opt/homebrew/lib")
  

  之后重新安装densvis：

  install.packages("densvis")
  

• 源码安装兜底方案
  如果上述方法无效，下载CRAN上的densvis源码包（如densvis_0.1.17.tar.gz），在终端执行以下命令手动指定gfortran路径安装：

  R CMD INSTALL densvis_0.1.17.tar.gz --configure-args="--with-gfortran=/opt/homebrew/bin/gfortran"
  

  注意替换命令中的源码包版本号为你下载的实际版本。

额外检查 #

• 确认你的R是arm64原生版本：在R中运行sessionInfo()，输出里的架构显示aarch64-apple-darwin20即为正确版本，若为x86_64则是Rosetta转译的Intel版本，建议重新安装arm64版R。
• 若之前装过Intel版gfortran，先执行brew uninstall gcc卸载，再重新安装arm64版本。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者studentYYY