编译安装deal.II 9.5.0-pre时BLAS/LAPACK符号检查失败求助

根据你提供的CMakeError.log信息，问题核心是链接阶段缺失依赖库，而非BLAS/LAPACK本身未安装，以下是针对性解决建议：

1. 补全pthread与Fortran链接依赖 #

日志中出现pthread_setaffinity_np和_gfortran_concat_string未定义引用，说明CMake在检查BLAS/LAPACK时，没有自动链接pthread线程库和gfortran运行时库。修改CMake命令，在LAPACK_LIBRARIES中补充这两个库：

cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/dealII \
-DDEAL_II_WITH_UMFPACK=ON \
-DDEAL_II_WITH_LAPACK=ON \
-DLAPACK_LIBRARIES="/usr/local/lib64/liblapack.a;/usr/local/lib64/libblas.a;/usr/lib64/libpthread.so;/usr/lib64/libgfortran.so" \
-DDEAL_II_WITH_MKL=OFF \
./..

如果优先使用系统的OpenBLAS（路径/usr/lib64/libopenblas.so），可以替换手动指定的blas/lapack库——OpenBLAS通常已内置pthread支持：

cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/dealII \
-DDEAL_II_WITH_UMFPACK=ON \
-DDEAL_II_WITH_LAPACK=ON \
-DBLAS_LIBRARIES="/usr/lib64/libopenblas.so" \
-DLAPACK_LIBRARIES="/usr/lib64/liblapack.so" \
-DCMAKE_EXE_LINKER_FLAGS="-lpthread -lgfortran" \
-DDEAL_II_WITH_MKL=OFF \
./..

2. 禁用MKL检测 #

日志提到MKL_SYMBOL_CHECK因缺少mkl.h失败，说明CMake默认尝试检测MKL但你并未安装。显式关闭MKL支持，避免干扰BLAS/LAPACK的检测流程：

-DDEAL_II_WITH_MKL=OFF

3. 让CMake自动查找BLAS/LAPACK（推荐） #

不要手动硬编码库路径，利用CMake自带的FindBLAS/FindLAPACK模块自动查找，同时指定BLAS供应商为OpenBLAS：

cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/dealII \
-DDEAL_II_WITH_UMFPACK=ON \
-DDEAL_II_WITH_LAPACK=ON \
-DBLA_VENDOR=OpenBLAS \
-DCMAKE_EXE_LINKER_FLAGS="-lpthread -lgfortran" \
-DDEAL_II_WITH_MKL=OFF \
./..

4. 验证库依赖完整性 #

手动检查你指定的BLAS/LAPACK库是否依赖其他库：

# 静态库用nm查看符号
nm /usr/local/lib64/libblas.a | grep pthread_setaffinity_np
# 动态库用ldd查看依赖
ldd /usr/lib64/libopenblas.so

如果静态库确实依赖pthread，必须在CMake中显式链接对应的库文件。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Goenitzer