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用于grep的正则表达式:提取含恰好4个碳的SMILES行

提取符合特定条件的SMILES行的正则方案

需求明确

从包含SMILES字符串的文本文件中提取满足以下所有条件的行:

  • 仅包含恰好4个碳原子(大写C或小写c)
  • 允许出现的字符:数字、括号()、等号=、井号#
  • 禁止出现的字符:方括号[]、连字符-、@符号@
  • 不能包含除C/c之外的其他大写字母

解决方案命令

使用grep扩展正则表达式模式实现:

grep -E '^[^C[]@-]*([Cc][^C[]@-]*){4}$' filename

正则模式拆解

  • ^:锚定行的起始位置
  • [^C[]@-]*:匹配任意数量的非禁止字符——排除C/c、[、]、@、-,确保没有违规字符提前出现
  • ([Cc][^C[]@-]*){4}:精确匹配4次「一个碳原子(C或c) + 任意数量非禁止字符」的组合,保证恰好4个碳原子
  • $:锚定行的结束位置,确保整行都符合规则

内容的提问来源于stack exchange,提问作者nightcod3r

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最近更新时间:2026.07.19 21:47:04