为何R语言显示因子水平为"0""1"，却输出1、2并以此绘图？

我仅使用as.factor()和factor()对包含0、1的数据进行因子转换，二者效果一致，但出现了矛盾的现象：

执行以下代码：

data$Class <- as.factor(as.numeric(data$Class))
str(data$Class)
data$Class

得到的输出：

Factor w/ 2 levels "0","1": 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 ...
   [1] 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

从输出看存在矛盾，我初步认为这是个bug。之后我尝试了两种解决方法：

• 新建变量重新处理：

  data$Class2 <- ifelse(data$Class == '1', 1, 0)
  data$Class2 <- factor(data$Class2)
  data$Class2
  

• 强制指定factor()的levels和labels参数：

  factor(data$Class, levels = c("0","1"), labels = c("0","1"))
  

但所有操作得到的结果完全一致，而且绘图时Class的显示值是1、2（见附图）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ackf