如何将Git仓库B的文件直接合并到仓库A（非子目录形式）

问题出在你拉取的Repo_B分支中，文件并非处于根目录，而是存放在子目录下，导致合并时不会与Repo_A根目录的同名文件产生冲突，反而直接作为子目录添加。以下是修正后的操作步骤，确保两个仓库的文件合并到同一根目录：

1. 确保Repo_A的master分支工作区干净
   先检查当前分支是否有未提交的变更，否则先提交或暂存：

   git status
   

2. 添加并拉取Repo_B的远程内容

   cd C:\repos\Repo_A
   git remote add Repo_B <remote-link-to-RepositoryB>
   git fetch Repo_B
   

3. 创建临时分支并调整Repo_B的文件到根目录

   • 基于Repo_B的master创建临时分支：

     git checkout -b temp-branch Repo_B/master
     

   • 将Repo_B子目录内的所有文件移动到根目录（假设子目录名为Repo_B）：

     git mv Repo_B/* .
     # 删除空的子目录
     git rm -r Repo_B
     

   • 提交这个目录调整：

     git commit -m "Move Repo_B files to root directory for merge"
     

4. 合并临时分支到master

   • 切回master分支：

     git checkout master
     

   • 执行合并并允许无关历史：

     git merge temp-branch --allow-unrelated-histories
     

此时，两个仓库根目录下的同名文件会触发合并冲突，你可以逐个解决这些冲突，之后提交合并结果即可得到合并后的项目版本。如果合并后仍有部分文件未触发冲突，说明这些文件仅存在于其中一个仓库中，Git会自动将其添加到工作区，你可根据需求保留或删除。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Comfortable_Onion