如何从gbff/gff/fna/gb等GenBank格式文件生成.gbk文件？

我用到的一款软件需要已被GenBank淘汰的GBK格式参考基因组，现在只能获取到替代的GBFF格式文件。找了一圈专用转换器没结果，还误把GB文件直接重命名成GBK格式，软件依然无法识别。

下面是验证可行的转换代码：

from Bio import SeqIO

# 指定输入输出文件名
input_file = "GCF_000013425.1_ASM1342v1_genomic.gbff"
output_file = "GCF_000013425.1_ASM1342v1_genomic.gbk"

# 读取GBFF文件
records = SeqIO.parse(input_file, "genbank")

# 写入标准GBK格式文件
SeqIO.write(records, output_file, "genbank")

补充说明 #

Biopython的SeqIO模块对GenBank系列格式兼容性极佳，这里的"genbank"格式参数既能正确解析GBFF文件，也能生成旧软件所需的标准GBK格式文件，无需额外调整文件内容结构。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Nar_sys