安装arrayQualityMetrics时Hmisc依赖包解析错误求助

你的错误根源是R 3.6.3不支持原生管道操作符|>——这个语法是R 4.1.0才正式引入的，而你尝试安装的Hmisc新版本代码中使用了该语法，导致旧版本R无法解析，最终安装失败。

以下是两种可行的解决方案：

方案一：安装兼容R 3.6.x的旧版Hmisc #

• 先清理失败安装的残留文件（如果存在）：

  remove.packages("Hmisc")
  

• 安装适配旧R版本的Hmisc（比如3.19-1版本，该版本未使用|>语法）：
  1. 若未安装devtools，先执行安装：

     install.packages("devtools")
     

  2. 安装指定版本的Hmisc：

     devtools::install_version("Hmisc", version = "3.19-1")
     

• 成功安装Hmisc后，再安装目标包：

  install.packages("arrayQualityMetrics")
  

方案二：升级R版本到4.1.0及以上 #

如果后续需要使用更多新功能或新包，建议直接升级R版本：

• 在Ubuntu 20.04上执行以下命令升级：
  1. 添加CRAN官方源：

     echo "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list
     

  2. 导入CRAN的GPG验证密钥：

     sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
     

  3. 更新软件源并升级R：

     sudo apt update && sudo apt install r-base r-base-dev
     

• 升级完成后重启RStudio，直接安装目标包：

  install.packages("arrayQualityMetrics")
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者shatty mariem