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如何使用gtsummary进行重复测量ANOVA分析?

可以用gtsummary实现重复测量ANOVA分析

当然可行,gtsummary可以很好地适配重复测量ANOVA的结果输出,下面结合你的数据集给出具体实现步骤:

1. 安装并加载所需包

首先确保安装了gtsummary:

# 首次运行时安装包
install.packages("gtsummary")

# 加载包
library(gtsummary)

2. 拟合重复测量ANOVA模型

你的数据是长格式(每个被试的每个时间点对应一行),可以用aov()函数拟合重复测量ANOVA,指定被试内误差项:

# 拟合单组重复测量ANOVA模型
rm_anova_model <- aov(value ~ Day + Error(Participant.ID/Day), data = smpl)

这里Error(Participant.ID/Day)表示以Participant.ID为被试、Day为被试内因素的误差结构,适配重复测量的设计逻辑。

3. 用gtsummary输出格式化分析表格

使用tbl_anova()函数将模型结果转换为美观的可复用表格:

# 生成并调整汇总表格
tbl_anova(rm_anova_model) %>%
  modify_caption("单组重复测量ANOVA分析结果(因变量:value,时间点:Day)") %>%
  bold_labels()

表格会自动展示Day因素的F值、自由度、p值等关键统计量,同时支持自定义标题、加粗标签等格式调整。

补充:多组重复测量ANOVA(若后续扩展数据)

如果后续数据中Randomization包含多个分组水平,可以拟合包含分组与时间交互项的模型:

# 拟合多组重复测量ANOVA模型
rm_anova_group_model <- aov(value ~ Randomization*Day + Error(Participant.ID/Day), data = smpl)

# 输出分组分析结果
tbl_anova(rm_anova_group_model) %>%
  modify_caption("多组重复测量ANOVA分析结果(分组:Randomization,时间点:Day)")

替代方案:线性混合模型(无需球形假设)

若重复测量ANOVA的球形假设不成立,可改用lme4拟合线性混合模型,再用gtsummary输出结果:

# 安装并加载lme4包
install.packages("lme4")
library(lme4)

# 拟合线性混合模型
lmer_model <- lmer(value ~ Day + (1|Participant.ID), data = smpl)

# 输出模型结果
tbl_regression(lmer_model, intercept = FALSE) %>%
  modify_caption("线性混合模型分析结果(被试随机效应:Participant.ID)")

内容的提问来源于stack exchange,提问作者CamCaan

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最近更新时间:2026.07.18 19:45:14