如何用Pandas按年份和航次统计指定列的空值数量

你的代码出现语法错误，核心问题是groupby(['year', 'cruise_id'])之后直接拼接df['extraction_no']的写法不符合Pandas的链式调用规则，正确的写法需要在分组后指定目标列，再对列执行空值统计操作。

以下是几种可行的解决方案：

方法1：链式调用apply统计空值 #

直接对分组后的extraction_no列应用空值统计逻辑：

eDNADFBlanksSummary = eDNADF.groupby(['year', 'cruise_id'])['extraction_no'].apply(lambda x: x.isna().sum())

方法2：用agg自定义统计结果列名 #

这种方式可以直接指定统计结果的列名，输出结构更清晰：

eDNADFBlanksSummary = eDNADF.groupby(['year', 'cruise_id']).agg(
    extraction_no_null_count=('extraction_no', lambda x: x.isna().sum())
)

方法3：先标记空值再分组求和 #

先新增一列标记extraction_no是否为空，再按分组求和，逻辑更直观：

# 新增空值标记列
eDNADF['extraction_no_is_null'] = eDNADF['extraction_no'].isna()
# 分组统计空值数量
eDNADFBlanksSummary = eDNADF.groupby(['year', 'cruise_id'])['extraction_no_is_null'].sum()

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Brandon Feole