R语言实现数据框按药品名称匹配合并,不匹配项填NA
问题解决:数据框按药物名称左连接未正确匹配的问题
需求:将DF1与DF2按药物名称匹配合并,匹配成功时带入DF2对应字段,不匹配项填充NA。但使用merge或left_join后,结果未达到预期。
示例数据
DF1
DF1 <- data.frame( Pat_ID = c("AB1", "AB1", "AB1", "Ax2", "Ax2", "Aq3", "Aq3", "Aw4"), Date = c("2010-12-09", "2010-12-15", "2010-12-15", "2010-12-09", "2010-12-17", "2011-02-09", "2011-04-25", "2011-04-25"), Code = rep("1.1.1", 8), Drug_Names = c("Alpha", "Alpha", "Beta", "Beta", "Beta", "Gamma", "Gamma", "Tango") )
DF2
DF2 <- data.frame( Codez = c("1.1.1", "1.1.3"), Drugz = c("Alpha", "Gamma") )
问题原因
你的连接逻辑本身正确,但大概率是匹配字段存在隐形空格或格式差异(比如DF2的Drugz字符串前后有空格,和DF1的Drug_Names无法精准匹配),导致连接时没有匹配上对应项,所以结果和DF1几乎一致。
解决步骤
- 先清理匹配字段,去除前后空格:
# 清理DF1的Drug_Names字段 DF1$Drug_Names <- trimws(DF1$Drug_Names) # 清理DF2的Drugz字段 DF2$Drugz <- trimws(DF2$Drugz)
- 执行左连接:
方法1:Base R的merge函数
DF3 <- merge(DF1, DF2, all.x = TRUE, by.x = "Drug_Names", by.y = "Drugz")
方法2:dplyr的left_join函数
library(dplyr) DF3 <- DF1 %>% left_join(DF2, by = c("Drug_Names" = "Drugz"))
最终结果
执行后将得到目标DF3:
# DF3输出结果 Drug_Names Pat_ID Date Code Codez 1 Alpha AB1 2010-12-09 1.1.1 1.1.1 2 Alpha AB1 2010-12-15 1.1.1 1.1.1 3 Beta AB1 2010-12-15 1.1.1 <NA> 4 Beta Ax2 2010-12-09 1.1.1 <NA> 5 Beta Ax2 2010-12-17 1.1.1 <NA> 6 Gamma Aq3 2011-02-09 1.1.1 1.1.3 7 Gamma Aq3 2011-04-25 1.1.1 1.1.3 8 Tango Aw4 2011-04-25 1.1.1 <NA>
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Usman YousafZai
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