如何在Cytoscape中向现有图谱添加新数据以扩展图谱?
无需代码扩展Cytoscape现有图谱的操作步骤
- 准备规范的新数据文件
确保新节点、新连接的数据格式和现有图谱匹配,比如用CSV格式:- 节点文件必须包含唯一标识列(如
id),可按需添加属性列(如名称、类型) - 连接文件必须包含源节点列(如
source)和目标节点列(如target),可添加边的属性列
- 节点文件必须包含唯一标识列(如
- 导入新连接数据
打开已加载图谱的Cytoscape窗口,依次点击菜单栏的 File -> Import -> Network from File...,选中新连接文件后打开;在导入向导里确认列映射正确,勾选*"Merge with current network"*,点击OK完成导入 - 导入新节点数据
重复上述导入流程,选择新节点文件,同样勾选*"Merge with current network"*,确保节点标识列匹配现有图谱的节点ID规则,完成导入 - 验证扩展效果
通过Network Navigator面板查看节点和边的总数变化,也可以用Select工具筛选新添加的元素,检查属性是否正常加载
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Y.C.
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