GitHub Action中指定安装GitHub版R包失败问题排查

问题根源 #

你手动安装GitHub版gyro后，执行r-lib/actions/setup-r-dependencies@v2步骤时，该动作会自动读取自有R包的DESCRIPTION文件解析依赖。如果DESCRIPTION里仅声明了gyro而未指定来源，它会默认从CRAN安装，覆盖之前手动安装的GitHub版本。

解决办法 #

方法一：修改R包的DESCRIPTION文件（推荐） #

在自有R包的DESCRIPTION文件中添加Remotes字段，明确指定gyro的GitHub来源：

Imports:
  gyro
Remotes:
  stla/gyro

这样setup-r-dependencies步骤会自动识别并安装GitHub版gyro，无需手动编写安装指令。GitHub Action YAML可简化为：

- uses: r-lib/actions/setup-r-dependencies@v2
  with:
    extra-packages: any::rcmdcheck
    needs: check

- uses: r-lib/actions/check-r-package@v2

方法二：在setup-r-dependencies中指定GitHub版依赖 #

如果不想修改DESCRIPTION，可以在setup-r-dependencies的extra-packages参数里直接指定GitHub版gyro，该步骤会优先安装指定版本：

- uses: r-lib/actions/setup-r-dependencies@v2
  with:
    extra-packages: |
      any::rcmdcheck
      github::stla/gyro
    needs: check

- uses: r-lib/actions/check-r-package@v2

这种方式下，之前手动安装remotes和gyro的步骤可以完全删除，setup-r-dependencies会自动处理依赖安装。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Stéphane Laurent