如何在Python中读取.gml文件?NetworkX调用read_gml时报错无法分词
解决NetworkX 3.1中read_gml()报"cannot tokenize at (1,1)"的问题
检查GML文件编码:这个错误常由文件编码不兼容引发,比如文件采用UTF-16或其他非UTF-8编码。可尝试指定编码读取:
import networkx as nx nx.read_gml('myfile.gml', encoding='utf-8')若无效,再试
encoding='latin-1'这类常见编码。验证GML文件格式合法性:(1,1)位置的错误说明文件开头就存在问题,可能是文件为空、开头含不可见字符(如BOM),或格式不符合GML规范:
- 打开文件确认第一行是否为合法的GML起始(比如
graph [),排查是否有多余空格、换行或特殊字符。 - 用VS Code等编辑器开启「显示控制字符」功能,查看是否有隐藏的BOM或无效字符,直接删除此类内容。
- 打开文件确认第一行是否为合法的GML起始(比如
手动修复文件开头:若文件开头确实存在无效内容(如空行、乱码字符),直接删除这些内容,确保第一行是
graph [开头的合法GML结构。降级NetworkX版本:NetworkX 3.x对GML解析的严格性有所提升,部分在旧版本可读取的不规范GML文件会触发报错。若上述方法均无效,可尝试降级到2.8.x版本:
pip install networkx==2.8.8之后再尝试读取文件。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Michael
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