为何R在命令行加载变量为factor，RStudio中却为character？

差异原因 #

• R原生的read.csv()函数默认会将字符串列转换为**因子（Factor）**类型，这是R的历史默认行为。
• RStudio的全局或项目设置中默认开启了stringsAsFactors = FALSE选项，而原生R命令行环境的默认值为TRUE。这一配置差异导致同样的代码在两个环境中读取CSV时，字符串列的类型出现分化：RStudio中为字符（character）型，命令行中为因子型。

标准解决方法 #

1. 读取时显式指定参数（推荐） #

在read.csv()中添加stringsAsFactors = FALSE参数，直接将所有字符串列读取为字符型，无需事后转换：

df = read.csv(path_to_df, sep = ",", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)
samples = df$sample
str(samples)  # 输出为chr类型

2. 设置全局默认选项 #

如果希望所有R会话（包括RStudio和命令行）都默认不将字符串转为因子，可以设置全局选项。将以下代码添加到你的.Rprofile文件中（该文件会在R启动时自动执行）：

options(stringsAsFactors = FALSE)

之后无论在哪个环境中使用read.csv()，字符串列都会默认是字符型。

3. 使用tidyverse的read_csv()函数 #

tidyverse生态中的readr包提供的read_csv()函数，默认将字符串列读取为字符型，同时读取速度更快、输出信息更友好：

library(readr)
df = read_csv(path_to_df)
samples = df$sample
str(samples)  # 输出为chr类型

内容的提问来源于stack exchange，提问作者je2018