Mac Big Sur环境下编译GitHub PROmiRNA项目时make阶段出现Clang段错误求助

你遇到的这个Clang段错误（Segmentation fault:11）在Mac环境下挺常见的，尤其是在仅安装了Command Line Tools而非完整Xcode的情况下，不过不用慌，咱们可以从几个方向尝试解决，不需要强制安装Xcode：

1. 修复或更新Command Line Tools #

虽然你已经有Command Line Tools，但组件损坏或者版本不匹配也可能导致Clang崩溃：

• 先尝试重新安装Command Line Tools：

  xcode-select --install
  

  如果提示已经安装，执行重置命令修复：

  sudo xcode-select --reset
  

  完成后重新检查Clang版本：clang --version，确认版本正常后再重新执行cmake和make。

2. 强制使用gcc/g++编译 #

你已经安装了gcc 9.4，而cmake默认可能调用了系统的Clang，咱们可以指定用gcc来编译，避开Clang的问题：

• 先进入你的build目录，清空之前的cmake缓存（避免残留配置）：

  rm -rf CMakeCache.txt CMakeFiles
  

• 然后用gcc作为编译器重新执行cmake：

  CC=gcc CXX=g++ cmake ..
  

• 最后执行make，看看是否能正常编译。

3. 降低编译优化级别 #

Clang在高优化级别下偶尔会出现崩溃，咱们可以关闭优化来尝试：

• 同样先清空build目录的缓存，然后执行cmake时添加优化参数：

  cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Debug -DCMAKE_CXX_FLAGS="-O0"
  

• 再执行make，Debug模式下默认优化级别低，大概率能避开段错误问题。

4. 检查项目代码兼容性 #

可以去PROmiRNA的项目仓库看看有没有其他Mac用户遇到类似问题，或者拉取最新的代码（如果你的代码不是最新版的话），因为项目维护者可能已经修复了Mac编译的相关bug：

• 执行git pull更新代码，然后重新走cmake和make流程。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者sian