如何在PyMOL Python脚本中判断文件是否已加载

PyMOL的Python API提供了两种简洁的方式来实现你需要的判断逻辑，具体如下：

方法一：直接使用cmd.exists()函数（推荐） #

cmd.exists()是PyMOL内置的判断函数，直接传入分子对象名称即可返回是否已加载的布尔值，用法最简单：

import pymol
pymol.finish_launching()  # 初始化PyMOL环境

target_id = "1abc"  # 替换为你的目标PDB ID或自定义分子名称

# 判断分子是否已加载，未加载则执行fetch
if not cmd.exists(target_id):
    cmd.fetch(target_id)
else:
    print(f"{target_id} 已加载，跳过本次fetch操作")

# 执行后续步骤

注意：如果使用fetch时自定义了分子名称（比如cmd.fetch("1abc", name="my_protein")），检查时必须传入这个自定义名称，而非原始PDB ID。

方法二：遍历已加载对象列表 #

通过cmd.get_object_list()获取当前所有已加载的分子对象名称列表，再判断目标名称是否在列表内：

import pymol
pymol.finish_launching()

target_name = "1abc"

# 获取所有已加载的分子对象名称
loaded_objects = cmd.get_object_list()

if target_name not in loaded_objects:
    cmd.fetch(target_name)
else:
    print(f"{target_name} 已存在，无需重复加载")

# 执行后续步骤

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Alex