CentOS Docker升级R至4.3.1后，R包安装路径报错问题咨询

问题原因 #

升级到R-4.3.1后，R的安装路径发生了变更：旧版本R-3.6.0通过yum安装后通常位于/usr/bin/R，但R-4.3.1的默认安装路径改为了版本专属目录/opt/R/4.3.1/bin/R，这就是你执行/usr/bin/R CMD INSTALL时提示“文件不存在”的核心原因。

直接解决方法 #

使用R-4.3.1的实际安装路径执行包安装命令，修改出错的代码行：

# Install R packages
RUN /opt/R/4.3.1/bin/R CMD INSTALL /tmp/Rpackages/yaImpute_1.0-33.tar.gz        && \
#    /opt/R/4.3.1/bin/R CMD INSTALL /tmp/Rpackages/ALEPlot_1.1.tar.gz            && \

可选优化（简化路径） #

如果想继续沿用/usr/bin/R的旧路径，避免修改所有R相关命令，可以在安装R后添加软链接：
在安装R的RUN指令末尾追加软链接命令：

RUN yum install -y java-1.8.0-openjdk-devel \
                   R-4.3.1 \    # Updated this line from R-3.6.0
                   devtoolset-8 --nogpgcheck && \
    yum install -y cmake3 \
                   ImageMagick-c++-devel \
                   proj \
                   proj-devel \
                   epel-release \
                   v8-devel && \
    # 添加软链接，将新版本R指向旧路径
    ln -s /opt/R/4.3.1/bin/R /usr/bin/R

这样后续所有使用/usr/bin/R的命令都无需修改，同时保留新版本R的版本专属路径，方便多版本管理。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Binit Amin