M1 Mac下PyCharm中Matplotlib架构不兼容报错求助

问题描述 #

在M1 Mac的PyCharm中运行读取MiniSEED文件并绘制地震波形的代码时，触发ImportError：matplotlib的_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so文件为arm64架构，但当前环境需要x86_64架构。尝试安装ARM64版本Matplotlib后，不确定文件结构是否正确，也不清楚PyCharm能否识别。另外，命令行pip show显示Matplotlib 3.7.1位于anaconda3目录，而PyCharm的Python解释器版本为3.7.2。

环境信息 #

• OSX Ventura 13.1
• PyCharm社区版2022.2.5（x86_64架构JVM）

运行代码 #

from obspy import read
import matplotlib.pyplot as plt

# 读取MiniSEED文件
st = read('/Users/petertsirushkin/Downloads/OO.HYS14..HDH.2020.092.00.00.00.000-2020.093.00.00.00.000.miniseed')

trace = st[0]
times = trace.times()
amplitudes = trace.data

# 绘制波形图
plt.plot(times, amplitudes)
plt.xlabel('时间 (s)')
plt.ylabel('振幅')
plt.title('地震波形')
plt.show()

报错信息 #

ImportError: dlopen(/Users/petertsirushkin/PycharmProjects/pythonProject1/venv/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so, 0x0002): tried: '/Users/petertsirushkin/PycharmProjects/pythonProject1/venv/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so' (mach-o file, but is an incompatible architecture (have 'arm64', need 'x86_64')), '/System/Volumes/Preboot/Cryptexes/OS/Users/petertsirushkin/PycharmProjects/pythonProject1/venv/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so' (no such file), '/Users/petertsirushkin/PycharmProjects/pythonProject1/venv/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so' (mach-o file, but is an incompatible architecture (have 'arm64', need 'x86_64'))

问题根源 #

PyCharm使用的是x86_64架构JVM，默认通过Rosetta 2运行，会强制调用x86_64模式的Python解释器，但你安装的Matplotlib是arm64架构，两者架构不匹配导致报错。同时PyCharm配置的解释器版本与命令行环境不一致，加剧了环境混乱。

解决步骤 #

1. 统一环境架构 #

方案A：继续使用x86_64环境

• 在PyCharm中配置基于x86_64的Python解释器（比如通过Rosetta 2启动的Anaconda环境）。
• 激活该环境后，重新安装Matplotlib：

  conda activate your_x86_env
  pip uninstall matplotlib
  pip install matplotlib
  

方案B：切换到arm64原生环境

• 安装支持arm64架构的PyCharm版本（2023.1及以上版本已原生支持arm64）。
• 配置arm64架构的Python解释器（如原生Anaconda或Homebrew安装的Python），确保Matplotlib为arm64版本。

2. 对齐PyCharm与命令行的Python环境 #

在PyCharm的File > Settings > Project: xxx > Python Interpreter中，选择命令行pip show matplotlib显示的anaconda3目录下的Python解释器，消除环境版本差异。

3. 验证架构匹配 #

在PyCharm终端执行以下命令，确认Python与Matplotlib架构一致：

# 检查Python架构
python -c "import platform; print(platform.machine())"
# 检查Matplotlib的.so文件架构
lipo -info /Users/petertsirushkin/PycharmProjects/pythonProject1/venv/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/_c_internal_utils.cpython-311-darwin.so

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Peter