Phyloseq稀释曲线单一类群占优，求解读与优化建议

vegan::rarecurve生成的稀释曲线：

我难以解读这条稀释曲线，不确定它是否合理，或是否暗示数据存在深层问题。

这是16S rRNA数据，已通过QIIME2结合DADA2处理，再使用QIIME2R包导入RStudio。

我已对phyloseq对象进行质控：

• 剔除读数少于10的OTU
• 剔除存在于少于5个样本中的OTU
• 剔除读数少于2000的样本

稀释曲线显示单一类群占优，属水平优势类群如下：

dominant_taxa                    n rel.freq rel.freq.pct
  <chr>                        <int>    <dbl> <chr>       
1 Streptococcus                   53     40.8 41%         
2 Bacteroides                     35     26.9 27%         
3 Corynebacterium                 22     16.9 17%         
4 Rikenellaceae_RC9_gut_group      4      3.1 3%          
5 Bifidobacterium                  3      2.3 2%          
6 Lachnospiraceae_NK3A20_group     2      1.5 2%          

该类群几乎存在于所有样本中。基于研究特性，群落可能多样性较低，但我不确定。是否有人遇到过类似情况？能否在分析流程上游采取优化措施？

感谢您的帮助！

生成稀释曲线的代码：

tab <- as.data.frame(physeq@otu_table)
rarecurve(tab, col = my_cols, step = 100, label = T)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Austin Weber