如何批量将多份TSV文件的第三列合并至首个文件（支持任意数量）

方法1：使用awk（高效适配任意数量文件） #

利用awk按行号存储内容，第一个文件保留完整行，后续文件仅追加第三列，命令如下：

awk '
BEGIN {FS=OFS="\t"}
FNR==1 {file_count++}
{
    if (file_count == 1) {
        line[FNR] = $0
    } else {
        line[FNR] = line[FNR] OFS $3
    }
}
END {
    for (i=1; i<=FNR; i++) {
        print line[i]
    }
}' file*.tsv > output.tsv

说明：

• file*.tsv会匹配所有以file开头的TSV文件，可根据实际文件名调整匹配规则
• 输出文件output.tsv的行顺序与原文件完全一致，不会出现错位

方法2：使用Shell循环+paste命令 #

适合文件名有规律的场景，通过循环逐个提取第三列并合并：

# 以第一个文件为基础初始化输出文件
cp file1.tsv output.tsv

# 遍历除第一个文件外的所有TSV文件
for file in $(ls file*.tsv | grep -v file1.tsv); do
    # 提取当前文件第三列，与输出文件合并
    paste output.tsv <(cut -f3 "$file") > temp.tsv
    mv temp.tsv output.tsv
done

说明：

• 如果文件名是file1.tsv、file2.tsv...fileN.tsv，可直接用file{2..N}.tsv替代循环里的文件名匹配
• 每次合并生成临时文件，最后替换原输出文件，实现逐步追加内容

注意事项 #

• 必须保证所有文件的行数一致，且每行前两列的内容、顺序完全匹配，否则会出现内容错位
• 处理超大文件时优先选择awk方法，避免多次读写临时文件带来的性能损耗

内容的提问来源于stack exchange，提问作者LJG