MacBook(arm64)加载R语言xlsx包遇Java兼容及崩溃问题求助

在arm64架构的MacBook上，使用arm64版本的R和RStudio加载xlsx包时遇到架构不兼容及JVM崩溃问题：

1. 初始加载错误：

> library(xlsx)
Error: package or namespace load failed for ‘xlsx’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(jli, FALSE)
  error: unable to load shared object '/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib':
  dlopen(/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib, 0x000A): tried: '/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib' (mach-o file, but is an incompatible architecture (have 'x86_64', need 'arm64')), '/System/Volumes/Preboot/Cryptexes/OS/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib' (no such file), '/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib' (mach-o file, but is an incompatible architecture (have 'x86_64', need 'arm64'))

2. 更换arm64版本JRE后，出现JVM致命错误：

# A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment:
#
#  SIGSEGV (0xb) at pc=0x00000002880bf2cc, pid=1308, tid=0x0000000000000103
#
# JRE version: Java(TM) SE Runtime Environment (8.0_381) (build 1.8.0_381-b09)
# Java VM: Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (25.381-b09 mixed mode bsd-aarch64 compressed oops)
# Problematic frame:
# v  ~StubRoutines::jshort_disjoint_arraycopy
#
# Failed to write core dump. Core dumps have been disabled. To enable core dumping, try "ulimit -c unlimited" before starting Java again
#
# If you would like to submit a bug report, please visit:
#   http://bugreport.java.com/bugreport/crash.jsp

终端执行java -version输出：

java version "1.8.0_381"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_381-b09)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.381-b09, mixed mode)

方案1：使用无Java依赖的替代包 #

xlsx依赖rJava，在arm64 Mac上兼容性问题较多，推荐改用纯R实现的包：

• 基础读写操作：使用readxl（仅读取）和writexl（仅写入），无需Java支持，安装命令：

install.packages(c("readxl", "writexl"))

• 复杂Excel操作：使用openxlsx，功能覆盖xlsx大部分场景，同样无需Java，安装命令：

install.packages("openxlsx")

方案2：修复rJava与arm64 Java的兼容性 #

如果必须使用xlsx，尝试以下步骤：

1. 彻底卸载旧Java：
   • 删除/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin
   • 删除/Library/PreferencePanes/JavaControlPanel.prefPane
   • 执行sudo rm -rf /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk<版本号>.jdk（替换为实际安装的旧Java版本）
2. 安装arm64版本的JDK 8：
   安装完成后设置环境变量，终端执行：

   echo 'export JAVA_HOME="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_xxx.jdk/Contents/Home"' >> ~/.zshrc
   echo 'export PATH="$JAVA_HOME/bin:$PATH"' >> ~/.zshrc
   source ~/.zshrc
   

   验证：echo $JAVA_HOME应显示arm64 JDK路径，java -version需显示架构为aarch64
3. 重新编译安装rJava：
   在RStudio中执行：

   install.packages("rJava", type = "source")
   

   安装完成后先加载rJava，再加载xlsx：

   library(rJava)
   library(xlsx)
   

方案3：使用Rosetta 2兼容模式 #

如果上述方案无效，可切换RStudio为x86_64模式：

1. 找到应用程序中的RStudio，右键选择「显示简介」，勾选「使用Rosetta打开」
2. 安装x86_64版本的JDK 8，并设置对应的环境变量
3. 重新安装rJava和xlsx包

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yunna Lin