如何在ggplot的stat_compare_means中自定义p值星号，将p<0.1设为*？

当然可以修改，用stat_compare_means的symnum.args参数就能自定义p值与星号的对应规则，具体操作如下：

自定义符号映射规则 #

你需要重新设置阈值区间和对应符号：

• 阈值区间cutpoints设为c(0, 0.001, 0.01, 0.1, 1)，对应四个区间：[0,0.001)、[0.001,0.01)、[0.01,0.1)、[0.1,1]
• 对应符号symbols设为c("***", "**", "*", "ns")，刚好满足你要的：p<0.001显示***，p<0.01显示**，p<0.1显示*，p≥0.1显示ns的需求

修改后的完整代码 #

把symnum.args参数加入你原有的代码中即可：

stat_compare_means(
  aes(label = paste0('', after_stat(p.format), ' ', after_stat(p.signif))),
  label.y = 450, 
  vjust = 1, 
  method = "t.test", 
  ref.group = "0", 
  size=3,
  fontface="bold",
  symnum.args = list(
    cutpoints = c(0, 0.001, 0.01, 0.1, 1),
    symbols = c("***", "**", "*", "ns")
  )
)

关键说明 #

symnum.args是stat_compare_means传递给底层symnum()函数的参数集合，通过调整cutpoints（阈值分界点）和symbols（对应符号）的一一对应关系，就能完全自定义p值的符号显示逻辑，后续如果需要调整其他阈值规则，直接修改这两个参数即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Steven