corrplot绘图输出异常求助：为何生成奇怪的相关系数图？

从你描述的异常绘图情况来看，大概率是你的correlation_matrix存在以下问题之一：

• 矩阵不是标准相关系数矩阵：相关系数的取值必须严格在[-1,1]区间内，如果传入的是协方差矩阵（数值通常远大于1）或其他非相关系数矩阵，corrplot会因无法正确映射数值而出现错乱。
• 矩阵包含缺失值（NA）或非数值类型：如果矩阵里存在NA、NaN或者字符数据，corrplot渲染时会出现布局异常。
• 矩阵结构异常：比如不是方阵、行名与列名不匹配，也会导致绘图显示混乱。

快速排查步骤 #

• 检查数值范围：

  range(correlation_matrix)
  

  确认输出结果在[-1,1]之间，若超出则说明你传入的不是相关系数矩阵，重新用cor()函数计算标准相关系数。

• 检查缺失值：

  any(is.na(correlation_matrix))
  

  如果返回TRUE，计算相关系数时添加缺失值处理参数，比如：

  correlation_matrix <- cor(your_data, use = "complete.obs")
  

• 验证矩阵结构：

  # 检查是否为方阵
  nrow(correlation_matrix) == ncol(correlation_matrix)
  # 检查行列名是否一致
  all(rownames(correlation_matrix) == colnames(correlation_matrix))
  

  若其中任意一项返回FALSE，需修正矩阵结构后再绘图。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Giordano Vitale