在macOS上安装FSL求助：已装XQuartz和conda，求适配脚本

已完成准备 #

• 已安装 XQuartz
• 已安装 conda

当前问题 #

找不到适配 macOS 的 FSL 安装脚本，尝试官方提供的脚本（代码示例如下）后仍有困惑：

VERSION="1.6"
POSIXLY_CORRECT=1

cecho () {
string=$@
my_os=`os`
if [ "X${my_os}" = "XLinux" ]; then
echo -e "$string "
elif [ "X${my_os}" = "XSunOS"  ]; then
echo "$string"
elif [ `darwin_release` -lt 9 ]; then
echo -e "$string"
else
echo "$string"
fi
}

skipped () {
message=$@

cecho "\033[34;1m[Skipped]\033[0m $message"
}

ok () {
message=$@

cecho "\033[32;1m[OK]\033[0m $message"
}

failed () {
message=$@

cecho "\033[31;1m[Failed]\033[0m $message"
}

warning () {
message=$@

cecho "\033[31m[Warning]\033[0m $message"
}

Usage () {
cat <<USAGE

fsl_installer.sh [-f  [-d ] [-x] [-e] [-p] [-h] [-C]]

安装步骤（新手友好） #

方法1：Conda 安装（最简便） #

1. 创建并激活 conda 环境：

   conda create -n fsl_env python=3.9
   conda activate fsl_env
   

2. 安装 FSL 相关包：

   conda install -c conda-forge fslpy fsl
   

3. 验证安装：运行 fslversion，输出版本信息即为成功。

方法2：官方 DMG 安装包 #

1. 下载对应 macOS 版本的 FSL DMG 安装包
2. 打开 DMG 后按向导完成安装
3. 配置环境变量：
   • 打开终端，编辑 ~/.zshrc 或 ~/.bash_profile（取决于你使用的 shell）
   • 添加以下内容：

     export FSLDIR=/usr/local/fsl
     source ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
     export PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
     

   • 执行 source ~/.zshrc 或 source ~/.bash_profile 使配置生效
4. 验证安装：运行 fslversion 检查。

注意事项 #

• 确保 XQuartz 处于运行状态，FSL 部分可视化工具依赖它
• Conda 安装后必须激活对应的环境才能使用 FSL 命令
• 遇到权限问题可在安装命令前加 sudo（确认操作后再执行）

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Samia