安装rstan时RStudio崩溃，寻求可行解决方案

• 补全系统级编译依赖
  rstan编译需要完整的C++开发环境，执行以下命令安装系统缺失的依赖：

  sudo apt-get update && sudo apt-get install build-essential libcurl4-openssl-dev libssl-dev libxml2-dev libfontconfig1-dev libharfbuzz-dev libfribidi-dev
  

• 配置R编译参数优化资源占用
  编译rstan时资源过载是卡顿崩溃的常见原因，可通过调整编译选项限制线程数并指定C++标准：

  1. 临时生效（仅当前R会话）：

     Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4")  # j后数字为CPU线程数，建议设为核心数的70%
     Sys.setenv(CXX14 = "g++ -std=c++14")
     

  2. 永久生效（编辑~/.R/Makevars文件，若不存在则创建）：

     CXX14 = g++ -std=c++14
     CXX14FLAGS = -O3 -march=native -mtune=native
     MAKEFLAGS = -j4
     

• 关闭RStudio后台编译功能
  打开RStudio的Tools -> Global Options -> Packages，取消勾选Compile packages in background，重启RStudio后再尝试安装。

• 改用终端直接安装
  避免RStudio的额外资源占用，打开Ubuntu终端输入R进入R环境，执行install.packages('rstan')完成安装。

• 解决内存不足问题
  若系统内存小于4G，编译时容易崩溃：

  1. 关闭所有非必要程序释放内存
  2. 临时创建swap分区补充内存：

     sudo fallocate -l 4G /swapfile
     sudo chmod 600 /swapfile
     sudo mkswap /swapfile
     sudo swapon /swapfile
     

     安装完成后可删除临时swap：

     sudo swapoff /swapfile && sudo rm /swapfile
     

• 从GitHub源码安装最新版rstan
  先安装devtools工具，再拉取最新源码编译：

  install.packages("devtools")
  devtools::install_github("stan-dev/rstan", ref = "develop")
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Juan