如何在GraphViz中让两个圆形节点相切？

你之前混淆了ranksep和nodesep的作用：ranksep是控制不同层级（rank）之间的间距，而同一rank内节点的间距由nodesep控制。要实现两个圆形节点相切，只需要针对目标节点局部设置nodesep=0即可，不会影响其他节点。

方法一：用子图局部控制间距 #

通过子图将需要相切的节点归为同一rank，并设置子图内的nodesep=0，既保证节点在同一水平/垂直线上，又让它们边缘紧贴：

graph [rankdir=LR];
  
  // 子图内的节点设置为同一rank，且间距为0
  subgraph {
    nodesep=0;
    rank=same;
    a [shape=circle];
    b [shape=circle];
  }
  
  x [shape=rect];
  x -> a;
  
  y [shape=rect];
  y -> a;
}

方法二：直接指定节点坐标（适合固定大小的节点） #

如果节点大小固定，可以通过pos属性手动设置坐标，让两个节点的边缘刚好接触。比如默认圆形节点的半径约为0.5，将两个节点的x坐标相差1（半径之和）即可：

graph [rankdir=LR];
  a [shape=circle, pos="0,0!"];
  b [shape=circle, pos="1,0!"];
  
  x [shape=rect];
  x -> a;
  
  y [shape=rect];
  y -> a;
}

第一种方法更灵活，节点大小变化时无需手动调整，推荐使用。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Gino