CentOS7环境下R语言安装xgboost包编译错误修复请求
解决CentOS7下R安装xgboost时的编译参数错误问题
我之前也碰到过一模一样的问题,这个编译错误的根源很清晰:xgboost的编译配置里把GCC的优化参数格式写错了——本该是-mtune=native和-march=native,结果写成了带空格的-mtune = native和-march = native,而GCC对命令行参数的格式要求很严格,不允许=前后加空格,所以才会抛出那些“找不到=/native文件”和“不识别-mtune参数”的错误。
下面给你两种可行的解决办法,任选一种都能搞定:
方法一:修改xgboost源码的编译配置
- 先把你下载的
xgboost_1.4.1.1.tar.gz解压到本地:tar xzf xgboost_1.4.1.1.tar.gz - 进入解压后的xgboost目录:
cd xgboost - 找到编译配置文件(通常是
src/Makefile或者项目根目录的CMakeLists.txt),搜索-mtune = native和-march = native这两行,把=前后的空格全部去掉,改成-mtune=native和-march=native。 - 保存修改后,回到R环境,执行本地安装命令:
install.packages("/你的解压路径/xgboost_1.4.1.1.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
方法二:通过环境变量强制覆盖编译参数(无需修改源码)
这个方法更简单,不用动源码,直接在启用devtoolset-7的shell里设置环境变量,强制替换掉错误的编译参数:
- 确保你已经通过
scl enable devtoolset-7 bash启用了新版GCC,然后执行以下命令设置环境变量:export CFLAGS="-mtune=native -march=native" export CXXFLAGS="-mtune=native -march=native" - 直接在当前shell里启动R,然后尝试安装xgboost(不管是从CRAN直接装还是本地包都可以):
install.packages("xgboost")
另外要注意:scl enable devtoolset-7 bash只对当前shell会话有效,如果你是通过图形界面启动R的话,可能需要先在终端里执行这个命令再启动R,确保R调用的是新版GCC。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Vishruth
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