如何将PyMOL中导入的新分子默认设置为ball and stick显示模式？

要实现每次导入新分子自动应用Ball and Stick显示，不能直接在pymol.rc中执行preset.ball_and_stick（启动时无分子可选择），也不能仅靠set stick_ball, on（仅开启stick的球选项，不改变默认显示模式），可以通过以下两种方法解决：

方法1：利用加载完成事件触发预设 #

在pymol.rc中添加以下代码，监听分子加载完成的事件，自动对新导入的分子应用Ball and Stick预设：

# 定义自动应用Ball and Stick的函数
def auto_ball_and_stick(filename, obj_name):
    preset.ball_and_stick(selection=obj_name, mode=1)

# 注册为加载完成后的回调函数
cmd.set('load_finished', 'auto_ball_and_stick')

这个方法会针对每个新加载的分子对象单独应用预设，不会影响已有的分子显示。

方法2：修改默认显示参数 #

如果不需要完整的preset配置，也可以直接修改PyMOL的默认显示设置，让新分子默认以带球的stick模式显示：

# 设置默认显示模式为stick
set default_show, stick
# 开启stick的球显示
set stick_ball, on
# 可选：调整球和stick的尺寸
set stick_radius, 0.15
set sphere_scale, 0.25

为什么之前的方法无效？ #

• preset.ball_and_stick(selection='all')在pymol.rc中执行时，PyMOL刚启动还没有任何分子，选择all为空，所以命令不生效。
• set stick_ball, on只是开启了stick显示时附带球的选项，但默认显示模式还是cartoon或其他，所以新分子不会自动用stick模式显示。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user21101711