如何自定义statannotations中星号格式的p值阈值？

要实现自定义p值与星号的对应规则，只需在annot.configure()方法中，通过**pvalue_thresholds**参数传入格式为{p值阈值: 星号标记}的字典即可。

注意事项 #

• 阈值需按从大到小的顺序定义，工具会匹配第一个满足p ≤ 阈值的规则；
• 建议保留1.0: 'ns'的映射，避免无显著性的p值出现无匹配标记的情况。

符合需求的自定义阈值字典 #

根据你需要的规则（*对应p≤0.0001，**对应p≤0.00001，***对应p≤0.000001），构造的字典如下：

custom_thresholds = {
    1.0: 'ns',
    0.0001: '*',
    0.00001: '**',
    0.000001: '***'
}

修改后的完整示例代码 #

from statannotations.Annotator import Annotator
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
import pandas as pd

df = sns.load_dataset("tips")
x = "day"
y = "total_bill"
order = ['Sun', 'Thur', 'Fri', 'Sat']
ax = sns.boxplot(data=df, x=x, y=y, order=order)
annot = Annotator(ax, [("Thur", "Fri"), ("Thur", "Sat"), ("Fri", "Sun")], data=df, x=x, y=y, order=order)

# 自定义p值阈值映射
custom_thresholds = {
    1.0: 'ns',
    0.0001: '*',
    0.00001: '**',
    0.000001: '***'
}

annot.configure(
    test='Mann-Whitney',
    text_format='star',
    loc='outside',
    verbose=2,
    pvalue_thresholds=custom_thresholds  # 传入自定义阈值参数
)
annot.apply_test()
ax, test_results = annot.annotate()
plt.savefig('example_custom_thresholds.png', dpi=300, bbox_inches='tight')

运行代码后，设置verbose=2会在控制台输出自定义的阈值规则，可验证是否符合预期。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者VeritatemAmo