安装fair-esm[esmfold]后出现ModuleNotFoundError: No module named 'scripts.utils'

问题重现 #

安装fair-esm[esmfold]相关依赖时，执行以下命令：

pip install "fair-esm[esmfold]"
pip install 'dllogger @ git+https://github.com/NVIDIA/dllogger.git'
pip install 'openfold @ git+https://github.com/aqlaboratory/openfold.git@4b41059694619831a7db195b7e0988fc4ff3a307'

触发错误：

Traceback (most recent call last):
File "", line 2, in 
File "", line 34, in 
File "/private/var/folders/_t/p573f1js2w5dx_xvd_h112h40000gn/T/pip-install-642l7elx/openfold_c56845d2684b4f048f7707a25b36ac5a/setup.py", line 21, in 
from scripts.utils import get_nvidia_cc
ModuleNotFoundError: No module named 'scripts.utils'

解决方案 #

直接通过pip install git+方式安装该指定commit的openfold时，pip临时构建环境无法正确识别仓库内的scripts模块路径，可按以下步骤操作：

1. 克隆openfold仓库并切换到指定commit：

git clone https://github.com/aqlaboratory/openfold.git
cd openfold
git checkout 4b41059694619831a7db195b7e0988fc4ff3a307

2. 完成前置依赖安装后，本地安装openfold：

pip install -e .

这种本地安装方式会让Python正确识别仓库内的模块结构，避免路径问题导致的导入错误。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者tobiaspol