无管理员权限Linux服务器安装rjags失败求助

问题原因 #

rjags的安装脚本默认会查找lib64目录，但你的conda环境未创建lib64软链接，JAGS实际存放在lib目录下，导致配置脚本无法定位到库文件。

解决步骤 #

• 手动指定路径安装rjags
  在R中执行以下代码，直接告诉配置脚本JAGS的实际位置：

  Sys.setenv(JAGS_HOME="/storage/hpc/data/iid49/miniconda/envs/Renv")
  install.packages("rjags", configure.args="--with-jags-lib=/storage/hpc/data/iid49/miniconda/envs/Renv/lib --with-jags-include=/storage/hpc/data/iid49/miniconda/envs/Renv/include")
  

• 创建lib64软链接
  激活Renv环境后，在终端执行命令，让lib64指向实际的lib目录：

  conda activate Renv
  ln -s /storage/hpc/data/iid49/miniconda/envs/Renv/lib /storage/hpc/data/iid49/miniconda/envs/Renv/lib64
  

  之后回到R中执行install.packages("rjags")即可。

• 直接用conda安装rjags（推荐）
  利用conda管理R包，避免编译路径问题：

  conda activate Renv
  conda install -c conda-forge r-rjags
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yulia Kentieva