如何在ggplot中按降序排列多个箱线图及对应aes属性

要让箱线图按Pn的均值降序排列Genotype类别，同时保留原有绘图的所有样式属性，你需要先对数据集的Genotype因子水平重新排序，再传入ggplot绘图。具体步骤如下：

步骤1：重新排序Genotype的因子水平 #

根据每个Genotype对应的Pn均值从高到低排序，把Genotype转换成指定顺序的因子：

# 加载必要工具包
library(dplyr)
library(ggplot2)

# 按Pn均值降序排列Genotype的因子水平
data_sorted <- data %>%
  group_by(Genotype) %>%
  mutate(mean_pn = mean(Pn, na.rm = TRUE)) %>%
  ungroup() %>%
  arrange(desc(mean_pn)) %>%
  mutate(Genotype = factor(Genotype, levels = unique(Genotype)))

步骤2：使用排序后的数据集绘图 #

用排序后的data_sorted替换原数据集，保留你原本的所有绘图参数：

ggplot(data_sorted, aes(x=Genotype, y=Pn, fill=Specie)) +
  stat_boxplot(geom = "errorbar") +
  scale_fill_manual(values=c('#e9002d', '#ffaa00', '#00b000')) +
  geom_boxplot(outlier.shape = NA, linetype = 3)

补充说明 #

• 这里默认按Pn的均值作为排序依据，如果你想按中位数或其他统计量排序，只需把mean(Pn, na.rm = TRUE)替换成median(Pn, na.rm = TRUE)即可。
• 重新排序因子水平后，ggplot会自动按新的水平顺序绘制x轴，实现降序排列的效果。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ikram Bashir