如何在R语言中从pcalg包的GES拟合结果获取邻接矩阵？

你可以通过以下两种方式从ges.fit$essgraph（一个EssGraph类对象）中提取邻接矩阵：

• 方法一：类型转换提取
  将EssGraph对象直接转换为矩阵类型：

  adj_matrix <- as(ges.fit$essgraph, "matrix")
  

  矩阵中，0代表变量间无边，1代表无向边，2代表有向边（方向可结合绘图结果对应）。

• 方法二：使用内置函数提取
  调用pcalg包专门的邻接矩阵提取函数：

  adj_matrix <- getAdjacency(ges.fit$essgraph)
  

提取完成后，可通过print(adj_matrix)查看结果，矩阵的行/列顺序与原始数据gmG8$x的变量顺序一致，可搭配colnames(gmG8$x)匹配对应变量名称。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jackie