如何解决R语言中Palmer Penguins包的CRAN镜像未设置错误？

兄弟，这个错误我太熟了！本质原因是你的R会话没有配置CRAN镜像源——而且当你编织R-Markdown文档时，会启动一个全新的独立R会话，这个会话不会继承你平时在控制台里手动设置的镜像配置。哪怕你在控制台里已经设过镜像，knit的时候还是会触发这个报错。

下面给你两种解决方案，按需选择：

方案1：临时配置（快速解决当前文档） #

直接在你的Rmd文档的第一个代码块里添加镜像配置，确保knit时的会话能正确访问CRAN：

# 先配置CRAN镜像（这里用清华镜像，国内访问速度快）
options(repos = c(CRAN = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

# 处理palmerpenguins包的加载/安装
if (!require(palmerpenguins)) {
  install.packages("palmerpenguins")
  library(palmerpenguins)
}

这样每次编织文档时，都会先设置好镜像再处理包的相关操作，不会再报错。

方案2：永久配置（一劳永逸） #

如果不想每次都在文档里加镜像代码，可以给R设置永久镜像，所有新会话（包括knit的会话）都会自动使用：

• 打开R/RStudio，在控制台输入：

chooseCRANmirror()

• 在弹出的窗口里选一个你偏好的镜像（比如国内的中科大、清华镜像，或者官方的cloud.r-project.org）
• 确认后，R会把这个镜像配置保存到你的.Rprofile文件里，重启R后就生效了，以后不管是控制台操作还是编织文档，都不用再手动设置镜像。

额外小贴士 #

• 如果你自己已经安装过palmerpenguins，其实可以直接写library(palmerpenguins)，不用加安装判断，但如果要把文档分享给其他人，加上判断语句会更友好，避免别人运行时因为缺包报错。
• 如果某个镜像访问失败，换另一个试试就行，CRAN有很多镜像节点可选。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者NoobKim