Mac最新版R安装GitHub包toolsForAtlas时出现连接错误求助

问题根源 #

从报错日志看，安装失败是因为R尝试读取renv/activate.R文件但找不到，这和Mac最新版R的兼容性无关，是目标GitHub仓库的renv环境配置文件缺失或未被正确拉取导致的。

解决办法 #

办法1：安装时跳过renv相关检查 #

用remotes安装时添加参数，跳过 vignettes 构建和不必要的环境检查：

remotes::install_github("sivanMargalit/toolsForAtlas", build_vignettes = FALSE, INSTALL_opts = "--no-multiarch")

要是还不行，先临时关掉renv的自动激活再安装：

options(renv.config.activate.prompt = FALSE)
remotes::install_github("sivanMargalit/toolsForAtlas")

办法2：手动克隆仓库本地安装 #

1. 打开终端，把仓库克隆到本地：

git clone https://github.com/sivanMargalit/toolsForAtlas.git

2. 进入克隆的文件夹，删掉.Rprofile里涉及renv激活的代码（如果有的话）；
3. 在R里执行本地安装：

install.packages("你克隆的仓库本地路径", repos = NULL, type = "source")

办法3：反馈给包维护者 #

如果上面的方法都没用，大概率是仓库本身的renv配置有问题，直接去GitHub仓库的Issues里告诉维护者，说明安装时找不到renv/activate.R文件导致失败即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Krista Oswald