group_by结合pairwise_t_test未返回统计量和自由度的问题

出现这种情况主要是因为你使用的pairwise_t_test（大概率来自rstatix包）的分组处理逻辑导致的：

• 当用group_by()配合pairwise_t_test()时，函数默认会以分组为单位输出精简的对比结果，哪怕设置了detailed=TRUE，分组上下文也会覆盖这个参数的作用，导致统计量、自由度这类细节字段没被包含在最终输出里。
• 另一个可能是旧版本rstatix的分组参数兼容问题，分组环境下detailed参数没有被正确传递到每个分组的独立检验计算中。

解决办法 #

方法一：拆分分组单独计算（推荐） #

不用group_by()，改用nest_by()拆分数据后对每个分组单独运行检验，确保detailed=TRUE生效：

library(tidyverse)
library(rstatix)

pwc <- df %>%
  nest_by(group) %>%
  mutate(test_result = list(data %>% pairwise_t_test(
    value ~ variable1, paired = TRUE,
    p.adjust.method = "bonferroni", detailed = TRUE
  ))) %>%
  unnest(test_result)

这样输出的pwc就会包含统计量、自由度以及所有详细结果。

方法二：更新rstatix包 #

如果是旧版本包的bug，更新到最新版本可能直接解决分组时的参数失效问题：

install.packages("rstatix")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者mehtam