如何将R脚本运算结果赋值给Bash变量CALC并屏蔽启动信息？

要屏蔽R的启动信息并仅获取运算结果，需从R脚本输出控制和Rscript调用参数两方面调整：

1. 修改R脚本，确保仅输出纯计算结果 #

原脚本直接写sum(...)会让R输出带格式的内容（比如[1] 123），同时fread默认会打印读取文件的提示。修改后的脚本如下：

targetFile <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
# 用quiet=TRUE关闭fread的读取提示
gg <- data.table::fread(file = targetFile, data.table = FALSE, quiet = TRUE)
# 用cat输出纯数值，避免额外格式前缀
cat(sum(gg$V1, gg$V2), "\n")

2. 调整Bash调用命令，抑制R启动信息 #

调用Rscript时添加--quiet参数，关闭R的启动欢迎/版本信息：

CALC=$(Rscript --quiet calc.R "arg.$j")
echo $CALC

补充说明 #

• --quiet（或简写-q）是Rscript的官方参数，专门用于抑制启动时的非必要输出；
• 如果仍有其他警告/提示，可在R脚本开头添加options(warn = -1)临时关闭警告输出，但建议仅在确认无风险时使用；
• 无需用数组赋值CALC=($(...))，直接用CALC=$(...)即可获取完整的数值结果。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者MAZ