求助：无法在RStudio中knit .Rmd为PDF/Word，CRAN镜像及工作目录异常

一、修复CRAN镜像设置（解决knit报错） #

报错提示trying to use CRAN without setting a mirror，说明R环境未配置默认CRAN镜像，导致knit过程中自动安装依赖包（如lmtest）时失败。直接在R控制台执行以下命令：

# 设置默认CRAN镜像（以清华镜像为例）
options(repos = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
# 保存镜像配置到Rprofile，重启后永久生效
writeLines('options(repos = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))', con = file.path(Sys.getenv("HOME"), ".Rprofile"))

执行后重启RStudio，再尝试knit文件。若仍提示安装包失败，手动安装lmtest：

install.packages("lmtest")

二、解决工作目录无法保存问题 #

工作目录自动还原通常是项目设置或Rprofile配置导致：

• 用RStudio项目锁定工作目录：点击RStudio右上角Project: (None) → New Project，选择你的代码所在文件夹创建项目。项目会自动固定工作目录，不会随意切换。
• 检查Rprofile配置：打开用户目录下的.Rprofile文件（执行file.edit(file.path(Sys.getenv("HOME"), ".Rprofile"))命令打开），删除类似setwd("xxx")的强制设置行，保存后重启RStudio。

三、排查knit失败的其他可能 #

若上述步骤后仍无法knit：

• 检查你的.Rmd文件中是否包含install.packages()类代码，建议将这类代码移到控制台手动执行，不要放在Rmd代码块中，避免knit时重复触发安装。
• 新建空白.Rmd文件（File → New File → R Markdown），保留默认内容尝试knit，排查是否为原有文件的代码问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者RRvbin