Unix下按文件名特征移动文件的Bash脚本无效果求助

问题背景 #

需要将cds.gff目录下的abc1_cds.gff、abc2_cds.gff等文件，移动到当前目录下名称末尾匹配abc#的已存在文件夹（如example_name_abc1、example_name_abc2）。当前目录结构如下：

[Linux@vaughan test]$ tree
.
├── cds.gff
│   ├── abc1_cds
│   ├── abc1_cds.gff
│   ├── abc2_cds
│   ├── abc2_cds.gff
│   └── abc_cds
├── example_name_abc1
│   └── distraction_abc1.txt
├── example_name_abc2
│   └── abc2_distraction_abc2.txt
└── move_files.sh

执行move_files.sh脚本后，文件位置无任何变化，原脚本内容如下：

#!/bin/bash

# Iterate over files in the "cds.gff" directory
for file in cds.gff/*.gff; do
  # Extract the filename without the path
  filename="${file##*/}"

  # Extract the last part of the folder name
  last_part_of_folder="${filename%_cds.gff}"

  # Check if there's a matching folder in the current directory
  if [ -d "$last_part_of_folder" ]; then
    # Move the file to the matching folder
    mv "$file" "$last_part_of_folder/"
  fi
done

问题原因 #

脚本核心逻辑错误：

• 从文件名提取的last_part_of_folder值为abc1、abc2，但实际目标文件夹名称是example_name_abc1、example_name_abc2，并非纯abc1或abc2。
• 脚本中的判断条件[ -d "$last_part_of_folder" ]是检查当前目录下是否存在**名称完全等于abc1/abc2**的文件夹，而这类文件夹实际不存在，因此不会执行mv命令。

解决办法 #

修改脚本逻辑，改为查找当前目录下**名称末尾匹配abc1/abc2**的文件夹，而非严格匹配目录名。以下是两种可行的修改方案：

方案1：使用find命令定位目标文件夹 #

#!/bin/bash

# 遍历cds.gff目录下的gff文件
for file in cds.gff/*.gff; do
  # 提取纯文件名（去掉路径）
  filename="${file##*/}"
  # 从文件名中提取标识符（abc1、abc2等）
  identifier="${filename%_cds.gff}"
  
  # 查找当前目录下以该标识符结尾的第一个目录
  target_folder=$(find . -maxdepth 1 -type d -name "*${identifier}" | head -n 1)
  
  # 如果找到目标目录则移动文件
  if [ -n "$target_folder" ]; then
    mv "$file" "$target_folder/"
    echo "已移动 $file 到 $target_folder"
  else
    echo "未找到 $file 对应的目标文件夹"
  fi
done

方案2：使用通配符匹配目录 #

#!/bin/bash

# 遍历cds.gff目录下的gff文件
for file in cds.gff/*.gff; do
  filename="${file##*/}"
  identifier="${filename%_cds.gff}"
  
  # 匹配所有以identifier结尾的目录
  for folder in *"${identifier}"; do
    if [ -d "$folder" ]; then
      mv "$file" "$folder/"
      break # 找到第一个匹配目录后停止循环
    fi
  done
done

两种方案都能正确定位到example_name_abc1这类目标文件夹，完成文件移动操作。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Geomicro