如何把R中system调用Python脚本的输出结果存入R对象？

你的问题出在两个地方：一是错误使用了readline()函数（它用于读取用户手动输入，而非捕获系统命令的输出）；二是默认调用system()时，命令的输出只会打印到控制台，不会返回给R对象。

以下是两种可行的解决方法：

方法一：使用system()的intern=TRUE参数 #

通过设置intern=TRUE，可以让system()把命令的输出以字符向量的形式返回，之后再转换为数值类型即可：

# 注意替换为正确的Python脚本路径和参数
xx <- system("python ./myScript.py 3 4", intern = TRUE)
# 将字符结果转为整数
xx <- as.integer(xx)

方法二：使用system2()函数（更推荐） #

system2()的参数设计更清晰，通过stdout=TRUE指定捕获标准输出：

xx <- system2("python", args = c("./myScript.py", "3", "4"), stdout = TRUE)
xx <- as.integer(xx)

额外注意事项 #

• 确保Python命令的正确性：如果你的环境中需要用python3而非python，替换掉对应命令即可；
• 检查脚本路径：确认./myScript.py或../my_pythonScript.py的路径与实际文件位置匹配，避免因路径错误导致无法执行脚本；
• 输出转换：因为捕获到的输出是字符类型，需要用as.integer()或as.numeric()转换为数值，才能进行后续数值运算。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user3236841