Ubuntu 22.04升级后OpenMPI损坏的修复求助

1. 手动修复libhdf5-openmpi-dev的update-alternatives错误 #

卸载时出现的update-alternatives: priority must be an integer错误，是因为h5pcc的替代项配置存在非整数优先级，按以下步骤处理：

• 查看当前h5pcc的替代项状态：

  sudo update-alternatives --display h5pcc
  

• 移除错误的h5pcc替代条目：

  sudo update-alternatives --remove h5pcc /usr/bin/h5pcc.openmpi
  

• 强制移除损坏的libhdf5-openmpi-dev包：

  sudo dpkg --remove --force-remove-reinstreq libhdf5-openmpi-dev
  

2. 修复损坏的mpi替代项文件 #

系统提示/var/lib/dpkg/alternatives/mpi损坏，需重建该文件：

• 备份原损坏文件：

  sudo cp /var/lib/dpkg/alternatives/mpi /var/lib/dpkg/alternatives/mpi.bak
  

• 重新创建mpi替代项配置文件：

  sudo tee /var/lib/dpkg/alternatives/mpi <<EOF
  auto
  /usr/bin/mpirun.openmpi
  30
  mpi
  /usr/share/man/man1/mpirun.1.gz
  /usr/share/man/man1/mpirun.openmpi.1.gz
  EOF
  

• 或通过命令重新注册替代项：

  sudo update-alternatives --install /usr/bin/mpi mpi /usr/bin/mpirun.openmpi 30
  

3. 清理并重新配置未完成的包 #

执行命令修复dpkg的未配置状态：

sudo dpkg --configure -a

若仍有错误，使用强制配置选项：

sudo dpkg --configure -a --force-all

4. 彻底卸载并重装OpenMPI相关组件 #

• 彻底清除所有OpenMPI关联包：

  sudo apt-get purge --auto-remove openmpi-bin openmpi-common libopenmpi-dev mpi-default-bin python3-mpi4py
  

• 重新安装必要组件：

  sudo apt-get install openmpi-bin mpi-default-bin python3-mpi4py
  

5. 验证修复结果 #

• 检查系统包状态：

  sudo dpkg --audit
  

• 完成inkscape升级：

  sudo apt update && sudo apt upgrade inkscape
  

• 测试OpenMPI功能：

  mpirun --version
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user509065