如何去除d3heatmap颜色透明度并解决行标签重叠问题

一、去除热力图颜色的透明度 #

d3heatmap默认会给颜色添加透明度，直接在函数里加alpha = 1参数就能完全关闭透明度，修改后的代码如下：

library("d3heatmap")
# alpha=1强制取消透明度
d3heatmap(b, col = coul, k_row =4, k_col = 4,show_grid = TRUE, key=TRUE, alpha = 1)

二、解决行标签重叠问题 #

有三种实用方案，按需选择：

• 缩小标签字体：用fontsize_row参数调小行标签字号，比如设为8（默认通常为10），代码示例：

  d3heatmap(b, col = coul, k_row =4, k_col = 4,show_grid = TRUE, key=TRUE, alpha = 1, fontsize_row = 8)
  

• 旋转行标签：通过row_text_angle参数把标签旋转一定角度（比如45度），避免横向重叠：

  d3heatmap(b, col = coul, k_row =4, k_col = 4,show_grid = TRUE, key=TRUE, alpha = 1, row_text_angle = 45)
  

• 仅显示部分行标签：手动指定要显示的标签，比如每隔5行显示一个，假设行名为rownames(b)，可以这样处理：

  # 生成自定义标签向量，每5行保留一个标签，其余设为空
  custom_row_labels <- ifelse(seq_along(rownames(b)) %% 5 == 0, rownames(b), "")
  d3heatmap(b, col = coul, k_row =4, k_col = 4,show_grid = TRUE, key=TRUE, alpha = 1, row_labels = custom_row_labels)
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Tommaso