为何pip安装pie包后，Python仍残留已移除的文件？

执行以下命令安装pie包时失败：

pip install --break-system-packages --user git+https://github.com/zurgeg/pie.git@ed00801

报错栈如下：

Traceback (most recent call last):
  File "/home/jg/.local/bin/pie", line 5, in <module>
    from pie.pie import cli
  File "/home/jg/.local/lib/python3.11/site-packages/pie/pie.py", line 20, in <module>
    from .crusts.notdate.play.playdate_pie import playdate as crust_playdate
  File "/home/jg/.local/lib/python3.11/site-packages/pie/crusts/__init__.py", line 7, in <module>
    globals()[submodule] = _import_module("." + submodule, __name__)
                           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/usr/lib/python3.11/importlib/__init__.py", line 126, in import_module
    return _bootstrap._gcd_import(name[level:], package, level)
           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/home/jg/.local/lib/python3.11/site-packages/pie/crusts/notdate/__init__.py", line 5, in <module>
    if not submodule.startswith("_"):

问题文件的历史背景 #

报错涉及的pie/crusts/notdate/__init__.py曾存在于仓库中，可通过以下git命令查看其历史提交记录：

git -P log --all --full-history --no-color -- src/pie/crusts/notdate/__init__.py |
awk 'match($0, /commit/){ print substr($0, RSTART + 7, 7) }'

输出结果：

aaef1b9
33210c5
bd3ded3

该文件是从原位置移动到当前路径的，提交aaef1b9的diff片段显示：

git diff aaef1b9 aaef1b9~1

diff --git a/src/pie/crusts/__init__.py b/src/pie/crusts/notdate/__init__.py
similarity index 58%
rename from src/pie/crusts/__init__.py
rename to src/pie/crusts/notdate/__init__.py
[...]

已尝试的无效操作 #

• 删除该文件后重新安装，问题依旧
• 执行pip uninstall pie后再安装，Python仍认为该文件存在
• 手动rm删除仅为临时方案，重新创建文件再删除后问题重复
• 升级包版本到0.2.2无效
• 使用虚拟环境或系统安装时，以下命令均无法解决：
  • pip install --no-cache-dir
  • pip install --force
  • pip install --force --no-cache-dir

核心疑问 #

期望重新安装包时该残留文件能被自动删除，但看起来pip未将其纳入包追踪范围，如何解决？

内容的提问来源于stack exchange，提问作者zurgeg