Windows下pip安装含Cython的Python模块时出现ModuleNotFoundError，Linux无此问题

在Windows环境下使用pip install -e（可编辑模式）安装时，pip的处理流程和Linux存在差异：pip会优先执行setup.py提取包的元数据，但此时install_requires中声明的Cython还未被安装，而你的setup.py在模块顶部直接导入了Cython.Build.cythonize，这就触发了ModuleNotFoundError。

直接运行python setup.py build_ext --inplace能成功，是因为当前Python环境已经提前安装了Cython；Linux上能正常工作，是因为pip在处理可编辑安装时，会优先安装install_requires中的依赖再执行setup.py（或环境中已有Cython缓存）。

方案1：用pyproject.toml声明构建依赖（推荐，符合PEP 518规范） #

在mymodule目录下创建pyproject.toml文件，内容如下：

[build-system]
requires = ["setuptools", "wheel", "Cython"]
build-backend = "setuptools.build_meta"

这个文件会告知pip：必须先安装这些构建依赖，才能执行setup.py。这样Cython会在构建前被自动安装，彻底解决导入问题。

方案2：延迟Cython的导入到setup函数内部 #

修改setup.py，将Cython的导入和cythonize调用延迟到setup()函数执行时，避免模块导入阶段触发：

from setuptools import setup, Extension

setup(
    name='mymodule',
    version='0.1',
    install_requires=['Cython'],
    ext_modules=__import__('Cython.Build').cythonize(
        Extension('calculations', sources=['calculations.pyx'])
    ),
)

这种方式兼容性稍差，仅作为备选方案。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者sunnytown