如何在R包的Vignettes文档中跨文档共享对象？

你遇到的问题其实很常见——每个Vignette都是在独立的R会话中编译的，所以第一个文档（aa）里创建的myobject并不会自动出现在第二个文档（bb）的会话里，自然会报“对象找不到”的错误。下面给你几个实用的解决办法：

方法1：重复创建对象（搭配knitr缓存优化） #

最简单的方式就是在bb文档里也运行创建myobject的代码：

# 在bb.Rmd的代码块中
myobject <- mypkg::myfct()
verif <- myobject[myfilters,]

如果myfct()运行速度慢，可以给代码块加上cache=TRUE参数，让knitr缓存结果，后续编译就不会重复执行耗时的代码了：

```{r cache=TRUE}
myobject <- mypkg::myfct()

## 方法2：保存对象到文件，再加载复用
在aa文档的末尾，把`myobject`保存到RData文件中：
```r
# 在aa.Rmd的最后一个代码块
save(myobject, file = "../vignettes/myobject.RData")

然后在bb文档开头加载这个文件：

# 在bb.Rmd的开头代码块
load("../vignettes/myobject.RData")
verif <- myobject[myfilters,]

⚠️ 注意：记得把myobject.RData添加到你的.gitignore文件里，避免把生成的中间文件提交到版本控制。

方法3：使用knitr子文档统一管理共享代码 #

把创建myobject的代码单独放在一个子文档里（比如vignettes/common_code.Rmd），内容就是：

myobject <- mypkg::myfct()

然后在aa和bb文档里都通过knitr::child()引入这个子文档：

```{r child="common_code.Rmd"}

这种方式最利于维护——以后如果要修改创建`myobject`的逻辑，只需要改子文档就行，不用在两个vignette里重复修改。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Damien Dotta